Gli organi della città metropolitana sono il Sindaco metropolitano, che è di diritto il sindaco del comune capoluogo, il Consiglio metropolitano, composto dal sindaco metropolitano e da consiglieri dei comuni della città metropolitana e la Conferenza metropolitana, costituita dai sindaci dei comuni della città metropolitana di Bari.
La Conferenza metropolitana è composta dal sindaco metropolitano, che la convoca e la presiede, e da tutti i sindaci dei comuni appartenenti alla città metropolitana di Bari.
